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小白菜貯藏病害中軟腐病造成的損害較嚴重，軟腐病有由細菌引起的，也有由真菌引起的。為了減少小白菜在貯藏中的損失，在采前要保持菜表面的干凈衛生，并在收獲前2~7天使用殺菌劑撲海因或苯菌靈進行噴灑。同時用0.004%的防落素溶液沿菜幫莖部向上均勻噴霧，可防止貯藏中脫幫。
貯運中小白菜的包裝最好用聚苯乙烯泡沫箱或瓦楞紙箱裝，用紙箱包裝的，箱內需用塑料薄膜作為內包裝，也可在碼垛后再在垛上覆蓋一層塑料薄膜帳，以較好地保持空氣相對濕度。但不論使用哪種包裝箱，都應在包裝前將包裝箱放入冷庫中冷卻。無冷藏設備的短期貯運，也可在泡沫箱內放置一層冰塊（用塑料袋裝好），盡可能使溫度維持在10℃以下。