《辦法》提出，國家救災農藥儲備遵循企業儲備、政府補助、市場運作、自負盈虧的運行原則。國家救災農藥儲備任務由企業自愿承擔并自負盈虧，所需資金可向中國農業發展銀行等申請貸款解決，中央財政給予資金補助。中央財政按照1年期貸款市場報價利率標準對國家救災農藥儲備給予資金補助。中央政府或地方政府利用農作物病蟲害防治資金采購農藥時，應優先采購國家救災儲備農藥。

《辦法》明確，國家救災農藥儲備品種選定堅持常態救災和非常態救災相統一、常規農藥與新型農藥相結合，主要用于滿足年度重大突發病蟲害防治用藥需求，并兼顧多年不遇非常見重大突發病蟲害救治用藥需求，國家救災農藥年度儲備時間為12個月。針對三大主糧（小麥、水稻、玉米）作物重大突發病蟲害防控需要及發生趨勢預測，由農業農村部組織專家提出年度具體儲備品種意見。

《辦法》指出，國家救災農藥儲備承儲企業兼顧大型農藥生產、流通企業，應具備5項基本條件：一是在中國境內具備農藥生產或經營許可證，具有獨立法人資格，經營正常；二是實繳資本原則上不低于3000萬元人民幣；三是近3年每年農藥銷售收入原則上不低于1億元人民幣（以年度審計報告為準）；四是符合國家產業政策規定和環保要求，具有與儲備規模相適應的倉儲能力；五是銀行信譽優良。