幾千尾銀魚進入云南，魚類間就掀起了一場大博弈，一種魚類多了，另一種魚類就少了，破壞了生態平衡。

滇池管理局相關人員說，云南四大土著魚類滇池金線鲃，星云湖的大頭魚、洱海的弓魚和撫仙湖的抗浪魚均不同程度減少和消失。滇池中的桂花魚、寬俳魚等28種土著魚數量迅速下降，其中金線鲃、中華倒刺鲃等13種是特有種類，基本絕跡，國家二級保護動物銀白魚幾近瀕危，而多鱗白魚、云南鲴等瀕臨絕跡。

滇池中銀魚、草魚等外來魚類日漸增多。滇池中的銀魚達3600噸，上升到銀魚的產量最高峰期，此后20年間銀魚數量基本維持在2000噸左右。

為了提高生物多樣性，保護本地魚種，近幾年來，滇池對本地魚類實行了封湖禁漁。而對于銀魚年年開捕，從未間斷，尤其是最近三四年來，對銀魚的捕撈權實行了拍賣，有的公司花了幾十萬的高價獲得捕撈權，便請來大量的捕撈者，對滇池的銀魚實行了毀滅性的捕撈，形成了全方位、地毯式的捕撈，銀魚從2010年相對較高的2600噸直線下滑，今年的最新調查顯示，滇池的銀魚只剩500噸，降到了銀魚的歷史最低點。