優選種子用于培育蘿卜芽菜的種子，應選擇生長勢優、抗病性強、品質好的蘿卜品種，如大紅袍、綠肥蘿卜、穿心紅等。種子要求是當年的，且整齊一致、籽粒飽滿、無病殘。

浸種催芽先將蘿卜種子清洗干凈，再在室溫下用多于種子3倍的清水浸泡8―10小時（期間需用流動的清水將種子沖洗1―2次，每次以沖至澄清為度），然后將種子置于23―26℃的條件下催芽。待種子露出胚根3―5厘米時，即可播種。

播種方式育苗盤和苗床均可播種。育苗盤要求底面平整、堅固耐用，且通透性好；栽培基質可選用白棉布或包裝紙。播種前先將育苗盤清洗干凈、進行消毒，再鋪上層栽培基質，然后將種子均勻地撒在育苗盤中的基質上（每盤播種100―150克）。播好種后，將育苗盤擺放到栽培架上即可。苗床最好是選擇疏松、肥沃且排水性能良好的沙壤土地塊，播前先要澆透水，然后采用撒播的方式將種子均勻地撒在苗床上（每平方米播種150―250克）。播好種后，覆蓋一層1厘米厚的疏松細土。

苗期管理主要是應注意溫度和光照的合理調控及通風，以保證芽菜的產量和品質。蘿卜芽菜苗期的生長溫度應控制在20―25℃，通風降溫時要注意不可讓風直接吹到芽苗上。由于蘿卜芽菜苗對光照的要求不高，故一般條件下即可。育苗盤播種的，應每天倒盤1次（上、下、前后地倒），使芽苗受光一致、生長整齊；反之，若光照過強，則產品因纖維含量高而影響口感。蘿卜芽菜苗對濕度的要求是：采用育苗盤播種的，應保持盤中基質濕潤但不能聚水，室內空氣濕度應控制在80％左右（可采用噴水或噴霧的方式進行調節）。采用苗床播種的，當幼苗長至3厘長時方可澆水，并應注意用水小而勤，以免爛苗。此外，在管理過程中，若發現病苗要及時檢出，以防止病害蔓延；病害嚴重時，可用多菌靈2000倍液噴霧防治。

適時采收育苗盤栽培的，當蘿卜芽苗長至1厘米以上時，即可整盤出售，盤可回收后再用。苗床栽培的，當芽菜苗呈翠綠色，苗高8―10厘米，子葉平展、充分肥大、有火柴棒粗時便可采收。采收時連根拔起，洗凈后立即包裝上市，以避免芽苗發黃而降低品質。